西日本主教教区の主教座聖堂（カテドラル）。京都府での正教伝道は、徳島に派遣されていた丹後地方間人（たいざ）出身のパワェル中小路伝教者が帰省中に間人や峰山で公開説教を行った明治13（1880）年にさかのぼる。京都市内では、同22（1889）年に市の中心部「押小路通高倉西入る」に講義所を設立。キリル笹葉政吉が専任伝教者として派遣され、大阪正教会管轄司祭イオアン小野荘五郎の臨時管轄下で伝道活動が開始された。 翌23年から26（1893）年までは、ロシア人修道司祭セルギイ（・ストラゴロドスキイ。後のロシア総主教。日本では掌院セルギイ「北海道巡回記」著者としても著名）が20歳代半ばの3年間京都での牧会にあたっている。 同27（1894）年に着任したシメオン三井道郎管轄時代、同30（1897）年に現在の境内地「柳馬場通二条上る」の京都能楽堂跡地を購入。同34年12月には京都府技師松室重光の設計監督になる現在の聖堂、生神女福音（受胎告知）聖堂が完成、同36（1903）年5月ニコライ主教の司祷により成聖された。当初は寮制の京都正教女学校も敷地内に併設され、東京からナデジタ高橋五子（いね）が舎監として派遣された。同39（1906）年にはアンドロニク（・ニコリスキイ。主教としての駐日期間は3ヶ月のみ）が、ニコライ主教の補佐として「京都の主教」に叙聖された。（アンドロニクは1918年に共産軍兵士に処刑され、2000年にロシア正教会より「神品致命者」として列聖。） 明治41（1908）年に来日しニコライ主教没後日本正教会の首座主教となったセルギイ（・チホミロフ）も当初は「京都の主教」の肩書であった。アンドレイ目時金吾管轄時代を経て、昭和7（1932）年着任したヴィッサリオン高橋長七管轄時代は大戦末期に「建物疎開」の命令を受けて取り壊し寸前となったが、終戦により幸いにも取り壊しを免れた。 昭和61（1986）年には京都市より有形文化財に指定、平成11（1999）年には床板修理・絨毯復原新調・内外塗装修理等を行い、現在は国指定重要文化財となっている。2000年5月にはロシア正教会アレクシイ2世総主教も当教会を訪れた。

1874（明治7）年に始まった大阪地方の伝道は、1878（明治11）年3月に実を結び、聴教者37名が領洗して講義所を開設、大阪正教会が誕生した。1910（明治43）年7月、大阪天満橋に木造ビザンチン式の聖堂が建立されて生神女庇護聖堂と命名された。この聖堂は日露戦争のロシア戦没者を記憶するため、ロシアの信徒の献品・献金により建立された。 1945（昭和20）年6月、惜しくも戦災により灰塵に帰した。1962（昭和37）年4月、大阪府吹田市の現在地にビザンチン様式を取り入れた鉄筋コンクリート造の聖堂を再建。イコノスタスはモスクワの聖像画師グリヤノフが制作し、愛媛県松山正教会から東京を経て大阪教会に移設された由緒あるものである。 大小6つの鐘楼の鐘は1910年にモスクワのコレスニコフ氏により献納され、戦時供出を免れた鐘が現在も祈りの時を告げている。堂内にはイリナ山下りんの「機密の晩餐」「生神女マリア」イコンが掲げられている。また聖ニコライと共に祈祷書・聖書を翻訳した漢学者パウエル中井木莵麿師は大阪教会の信徒であった。フィンランドで活躍したペトロス佐々木師による『就寝聖像』は2024年に修復され、今も大切に用いられている。

1873年ペトル笹川神父の伝道に始まる。1913年神戸市平野祇園町に会堂。1920年代トアロード及び籠池野崎通りに、ロシア革命による亡命ロシア人たちによって2階建教会が建てられた。1952年、現在地の山本通に「生神女就寝聖堂」が建立された。異人館が建ち並ぶ北野の歴史的な街並みの中に位置し、長年にわたり多国籍な信徒が祈りを共にしてきた。

2025年9月に新しく和歌山市内に会堂を開設。京都ハリストス正教会の管轄司祭パウェル及川信神父のもと、紀州・和歌山地域における祈りの場として活動を開始した。

【名古屋への伝道】1874（明治7）年、桶屋町（現在の伏見周辺）で「生神女福音教会」として集会を開始。明治30年頃富士塚町（現・富士中付近）に移転。日露戦争時には各所に多数のロシア人捕虜が収容され、日本家屋の教会が心の拠り所となった。大正12年に2階建ての立派な聖堂が建立されたが第二次大戦で焼失。1949年昭和区山花町に移転し、1972年再建。2006年に山脇町への移転新築を決定し、2010年1月に現在の美しい聖堂が完成した。 【神現聖堂の名称】ヨルダン川で洗礼を受けられた神の子イイススに天が開け聖神がくだり、父なる神が「これはわたしの愛する子」と告げられ至聖三者（三位一体）の神が顕現された出来事に由来する。 【建物の特徴】正面3連、側面4連のヴォールト屋根にタマネギ型のクーポール（ドーム）を載せた中世ロシアの聖堂建築様式。内部は木の板を丹念に貼り合わせ、ビザンティン様式の輪型シャンデリアとともに柔らかな祈りの空間を醸し出している。

1875（明治8）年開教。現聖堂は1913（大正2）年建立。聖職者であり名建築家であった河村伊蔵（ハリストス正教会司祭・モスクワ神学校卒）による設計。木造下見板張りの美しいロシア・ビザンチン様式建築で、2008年に国の重要文化財に指定された。内部には山下りんの聖像画や伝統的なイコノスタスが今も守られている。

知多半島のほぼ中央部に位置する、かつて綿織物で栄え醸造で名高い半田市にある。大正2（1913）年に建てられた会堂が今も堅牢な姿で立っている。明治16年に名古屋から伝教者が半島西南端に近い内海村にやって来て48名が洗礼を受けたことにはじまり、明治18年に半田に正教がもたらされた。 第二次世界大戦後に乙川の教会と統合して現在の半田教会となった。会堂建築は当時の知多半島の宮大工が苦心して和洋の技術を結集させたもので、イコノスタスの聖像はロシア製（18〜19世紀作）。半田市指定文化財に指定されている。

明治10年に中小路誠一郎が派遣されて伝道開始。徳島出身の小川一郎が明治11年1月23日大阪の高屋神父より受洗後、14年に副伝教者となって脇町を中心に活動した。宮井医師らも受洗して江原村で助け、脇町には大正初期までに徳島市を超える200名以上の信徒がいた。日露戦争時には丸亀の捕虜収容所に真木神父が出張した。 大正5年から昭和20年まで梯神父が奉職したが、戦災により徳島以外の教会は焼失。昭和48年より小川神父が管轄司祭となり活動が活発化、昭和55（1980）年に現在の聖神降臨聖堂が建設された。堂内のイコノスタスは明治時代に浜松教会で使用された後、豊橋、名古屋教会を経て徳島に移されたもので、明治25年頃にイリナ山下りんによって描かれた貴重な聖像画群が奉掲されている。

明治22年に柳井原出身のコルニリイ浅野久吉が受洗したことから始まった。家族を洗礼に導いて柳井原会堂の基礎を築き、明治35年には石巻出身の渡邊伝教者を迎えて盛んになった。明治から大正にかけ岡山、津山、妹尾、加須山、連島、児島、柳井原など岡山県内各地で精力的な宣教が展開された。 昭和38（1963）年、大阪教会の移転新築に伴い、大阪教会の旧会堂を譲り受けて移築した。聖堂内にはイリナ山下りんの聖像画が数点大切に受け継がれている。

九州地方の正教会活動を統括する拠点教会。管轄司祭の水野神父のもと、福岡をはじめ熊本・人吉・鹿児島・宮崎など九州全域の信徒の牧会と巡回礼拝を担当している。

歴史の古い教会であるが第二次世界大戦後に旧会堂を失った。信徒の熱心な祈りと尽力により1962年に現在の敷地を購入して念願の会堂を建設した。毎月一度、福岡教会より水野神父が巡回して主日聖体礼儀が行われている。

1932（昭和7）年に現在地に移転した。小高い丘の上に建つ聖堂は約400坪の豊かな敷地にある。人吉生神女マリヤ庇護聖堂には、かつてロシアから運ばれた古いイコンが大切に奉掲されている。球磨川と山々に囲まれた人吉の歴史的景観に調和する聖堂である。

明治時代に2度にわたって焼失した聖堂は、その都度全信徒の献身によって再建された。第二次世界大戦末期にも戦災にあって再度焼失したが、当時の管轄司祭大木神父を中心に全信徒が奮起し現在の聖堂を建設。1957年にイリネイ大主教によって成聖式が行われた。 桜島の降灰、地震、台風など自然の試練が多い薩摩の地で、正教の信仰は脈々と今も受け継がれている。立地条件にも恵まれ、鹿児島の中心市街地に位置する。